通过检查明确反复自然流产的原因，针对病因进行治疗。
   一、治疗生殖器官的异常：如有子宫纵隔可行切除术，近年来在宫腔镜下行该术效果良好，若因宫颈机能不全引起反复性自然流产可在妊娠13~15周时进行宫颈环扎术，有的患者因而反复流产，若肌瘤为单发或数量不多者可行肌瘤剜出术。
    二、感染的治疗：支原体、衣原体及弓形虫感染可用强力霉素、青霉素及红霉素等药物治疗，妊娠期间感染宜用红霉素或青霉素治疗，对胚胎无不良影响。强力霉素属四环素族抗生素，对胚胎有不良影响，不宜应用。
    三、内分泌治疗：首先要进行内分泌检查确定为黄体功能不全者，因不能分泌足够量的孕激素而影响胚胎发育及蜕膜、胎盘的形成，应补充黄体酮进行治疗，并在医生指导下给适量绒毛膜促性腺激素，对高泌乳素血症患者用溴引亭，2.5mg每天1次口服，高雄激素血症者应用协同解郁种玉丸及螺内酯治疗，内分泌调整正常后再妊娠，因为内分泌失调情况下受孕容易流产。
   风疹病毒，单疱病毒Ⅰ、Ⅱ型，弓形虫及巨细胞病毒感染可引起发育异常及流产，尤其是巨细胞病毒广泛存在于人群中，大部分为亚临床感染或潜伏感染，不出现临床症状，免疫功能低下时易发生潜伏感染的活动化，可用协同抗病毒煎毒必清，通过清热解毒对病毒进行治疗。
   四、中医中药治疗：反复性自然流产，先兆流产及黄体功能不健全者通过益气固肾而安胎，服用协同安胎药有较好的疗效。